Plusieurs questions :)

Joséphine

Bonjour,
Samuel Pereira Dias et moi-meme travaillons actuellement sur un projet de restauration et protection des forets alluviales de Durance. Je suis donc entrain de modéliser la connectivité des habitats dans le cadre du mouvement d'un modèle hybride de chauve-souris.

J'ai essayé plusieurs versions de graphs et de jeux de liens. La topologie complète donnait vraiment des formes très géométriques, parfois meme des 'clusters' de lignes qui semblent suivre les pixels du raster de la COS. C'est normal? Quand conseillez-vous de choisir une topologie planaire VS complète?
Je ne suis pas certaine de comprendre à quoi sert la DistMax lors de la formation d'un jeu de lien. La taille maximale de l'habitat et la distance de dispersion élaguée me semblaient déjà assez pour modéliser les chemins d'une chauve-souris. Pourriez-vous m'en dire plus?
Dans quel cas choisir ou non de cocher les cases 'supprimer les liens traversant des taches' et 'inclure les distances intra-taches' lors de la création d'un graph?
Dernière question (et la plus importante pour nous): Que se passe-t-il durant la fusion de 2 graphes? Nous avons deux habitats différents, les zones de gite VS les zones de chasse. Nous aimerions avoir des liens entre les zones de gites ET des liens entre les zones de gite-zone de chasse. J'ai donc pensé à fusionner les deux graphes, mais je me suis demandé si c'était une simple 'addition'?
Lorsque je veux ensuite calculer les métriques (locales et globales), quelle distance (en UC) dois-je choisir? Car celle-ci est différentes entre le jeu de lien 'gite-gite' et le jeu de lien 'gite-chasse'.

Merci d'avance,
Bien à vous,
Joséphine Bur

gvuidel

Bonjour Joséphine,

La topologie complète est la plus réaliste mais souvent plus lourde à calculer et plus difficile à cartographier car elle contient souvent énormément de liens. Pour faire une cartographie du réseau nous utilisons par défaut la topologie planaire. Par contre si vous comptez modifier le graphe (delta-métrique, modification d'OS, ajout de taches) il est préférable de partir sur une topologie complète.
La paramètre Distmax est bien l'équivalent de l'élagage du graphe. Mais il permet de limiter le calcul du jeu de liens en amont du graphe. Ce paramètre est surtout utile avec une topologie complète.
La case "Supprimer les liens traversant les taches" est à utiliser avec une topologie complète pour éliminer les chemins en partie redondants. Elle est utile pour les métriques BC, CF et delta métrique selon ce que l'on veut montrer. L'option "Inclure les distances intra-taches" est toujours à conserver cochée. Sauf dans le cas de l'ajout de tache où cette option doit être décochée.
La fusion de 2 graphes correspond bien à la combinaison des noeuds des 2 graphes ainsi que des liens des 2 graphes. Son utilisation avec des métrique peut être relativement complexe. Tout dépend de vos objectifs

Bonne journée,
Gilles

Joséphine

Bonjour Gilles,

Merci beaucoup pour les réponses précises.
Que me conseilleriez-vous comme approches pour comparer différents multigraphs (comparaison sur la base des résultats de métriques)?
Une autre alternative serait de combiner habiter de nichoirs et zone de chasse dans un seul type d'habitat, mais cela forcerait à avoir des liens entre zones de chasse.

Merci d'avance,
Joséphine Bur

gvuidel

Bonjour Joséphine,
Je me demande s'il ne faudrait pas partir sur une solution plus simple.
Une solution pour tenir compte des zones de chasses sans faire de multihabitat est de calculer la capacité des gîtes en fonction des zones de chasses présentent autour de ceux-ci.
Ce calcul est possible dans le menu Habitat -> Capacité des taches où vous pouvez calculer une superficie d'éléments spécifiques (zones de chasse) autour de vos habitats (vos gîtes).
Après vous pouvez faire votre graphe classique de dispersion à partir uniquement de vos gîtes. Les zones de chasses sont prises en compte indirectement par la capacité des gîtes.
Bonne journée,
Gilles